生物信息

单细胞分析实录(19): 基于CellPhoneDB的细胞通讯分析及可视化 (下篇)

在上一篇帖子中，我介绍了CellPhoneDB的原理、实际操作，以及一些值得注意的地方。这一篇继续细胞通讯分析 […]

细胞通讯分析可以给我们一些细胞类群之间相互调控/交流的信息，这种细胞之间的调控主要是通过受配体结合，传递信号来 […]

下午花了两个小时回答读者的疑问，觉得可以记录下来，也许能帮到一部分人。第一位读者做的是非模式物种的单细胞。 […]

前几天分析了一批单细胞TCR的数据，需要画这样一个图：行是不同的样本，列是不同的T细胞类型，每一个位置点的大 […]

上一篇已经讲解了Seurat标准流程，推文的最后，注意到了不同样本之间的表达数据是存在批次效应的，就像下图这样 […]

当我们在绘制散点图的时候，可能会遇到点特别多的情况，这时点与点之间过度重合，影响我们对图的认知。为了更好地反映 […]